Magnesia liegt innerhalb der Grenzen des Gouvernement von Aydın, der Regionalverwaltung von Germencik, der Gemeindeverwaltung von Ortaklar und der Dorfverwaltung von Tekinköy. Die antike Stadt liegt an der Landstraße zwischen den Ortschaften Ortaklar und Söke und ist von Izmir über Selçuk; von Aydın über Germencik oder aber über Söke zu erreichen. Magnesia ist 100 km von Izmir, 4 km von Ortaklar und 16 km von Söke entfernt. Von der Autobahn kommend, sollte man nach der Ausfahrt Bodrum-Söke Richtung Ortaklar fahren, um nach etwa 1,5 km in Magnesia anzukommen.
           Fährt man über Selçuk und Ortaklar nach Magnesia sollte man zuerst am Museum für Dampf-Lokomotiven in Çamlık einen Halt machen. In Ortaklar sollte man dann durch die Stadt Richtung Selatin fahren, das von Ortaklar 12 km entfernt ist. Die Ortschaft Selatin gab dem 3043 m langen Autobahntunnel zwischen Izmir und Aydın seinen Namen, dem längsten in seiner Art in der Türkei. Im Stadtzentrum von Selatin steht ein Platane (Platanus Orientalis), die 800 Jahre alt ist. Der Durchmesser des Stammes beträgt 8,65 m, und der des Schattenbereiches 35 m. Der Baum ist 17,5 m hoch und wurde 2002 mit der Registrierungsnummer 10448 des Denkmalpflegeamts der 2. Kommission von Izmir unter Naturdenkmalschutz gestellt.
           Aus Aydın kommend sollte man von Germencik zuerst nach Mursallı fahren und sich dort im Stadtzentrum die große Kirche anschauen, um dann über die asphaltierte Straße durch Tekinköy nach 3 km nach Magnesia zu gelangen.